公司轉(zhuǎn)讓中的債權(quán)債務(wù)糾紛的處理方法有：盡職調(diào)查、協(xié)議，轉(zhuǎn)讓方對或有債務(wù)提供擔(dān)保和擔(dān)保；進(jìn)行資產(chǎn)評估，關(guān)注表外因素；可以協(xié)議方式就債權(quán)債務(wù)達(dá)成協(xié)議，沒有協(xié)議的可同時(shí)轉(zhuǎn)讓。首先要明確整體轉(zhuǎn)移的具體方式，不同的方式會(huì)產(chǎn)生不同的法律后果。

公司轉(zhuǎn)讓中的債權(quán)債務(wù)糾紛按以下規(guī)定處理： 《公司法》第一百七十三條規(guī)定，公司合并，應(yīng)當(dāng)由合并各方簽訂合并協(xié)議，并編制資產(chǎn)負(fù)債表及財(cái)產(chǎn)清單。公司應(yīng)當(dāng)自作出合并決議之日起十日內(nèi)通知債權(quán)人，并于三十日內(nèi)在報(bào)紙上公告。債權(quán)人自接到通知書之日起三十日內(nèi)，未接到通知書的自公告之日起四十五日內(nèi)，可以要求公司清償債務(wù)或者提供相應(yīng)的擔(dān)保。 第一百七十四條規(guī)定，公司合并時(shí)，合并各方的債權(quán)、債務(wù)，應(yīng)當(dāng)由合并后存續(xù)的公司或者新設(shè)的公司承繼。 第一百七十六條規(guī)定，公司分立前的債務(wù)由分立后的公司承擔(dān)連帶責(zé)任。但是，公司在分立前與債權(quán)人就債務(wù)清償達(dá)成的書面協(xié)議另有約定的除外。