1、行為對(duì)象不同。行政確認(rèn)是指對(duì)行政相對(duì)人既有法律地位、權(quán)利義務(wù)的確定和認(rèn)可，主要是指對(duì)身份、能力和事實(shí)的確認(rèn);行政許可的行為對(duì)象是許可行政相對(duì)人獲得為某種行為的權(quán)利或資格。 2、行為性質(zhì)不同。行政確認(rèn)屬于確認(rèn)性或宣示性行政行為，它僅表明現(xiàn)有的狀態(tài)，而不以法律關(guān)系的產(chǎn)生、變更或消滅為目的。 3、所為的意思不同。行政確認(rèn)行為表明行政主體的態(tài)度是對(duì)某種狀態(tài)、事件、物或行為予以法律上的承認(rèn)、確定或否定;而行政許可行為則是行政主體在對(duì)申請(qǐng)人的申請(qǐng)進(jìn)行審查和判斷的前提下，對(duì)申請(qǐng)是否予以準(zhǔn)許或同意的行為。

行政確認(rèn)行為與行政許可行為緊密聯(lián)系：行政許可與行政確認(rèn)常常是同一行政行為的兩個(gè)步驟，一般是確認(rèn)在前，許可在后，確認(rèn)是許可的前提，許可是確認(rèn)的結(jié)果。 但二者的區(qū)別則主要表現(xiàn)為兩個(gè)方面： 其一，行為對(duì)象不同。行政許可的行為對(duì)象是許可行政相對(duì)人獲得為某種行為的權(quán)利或資格，主要是作為性的行為;行政確認(rèn)則是指對(duì)行政相對(duì)人既有法律地位和權(quán)利義務(wù)的確定和認(rèn)可，主要是指身份、能力和事實(shí)的確認(rèn)等等。 其二，行為的法律效果不同。行政許可是準(zhǔn)許行政相對(duì)人今后可以為某種(對(duì)一般人禁止的)行為，其法律效果具有后及的性質(zhì)，不具有前溯性;行政確認(rèn)則是對(duì)既有的身份、能力、事實(shí)的確定和認(rèn)可，其法律效果具有前溯性，對(duì)今后僅是一種預(yù)決作用。