在程序上，要對獨資企業(yè)的資產(chǎn)進行評估，然后征詢夫妻雙方的意見，考慮其個人是否希望獲得該企業(yè)。然后由取得企業(yè)一方給予另一方相應(yīng)的財產(chǎn)性補償； 如果是雙方均主張經(jīng)營該企業(yè)的，司法實踐中一般會進行雙方競價作為基礎(chǔ)，然后再由取得企業(yè)的一方給予另一方相應(yīng)的補償。這主要考慮到競價方式的公平性和實際可操作性，防止結(jié)案之后，由于一方無法支付相應(yīng)的折價款而造成執(zhí)行不力。雙方當(dāng)事人在獲得企業(yè)所有權(quán)的機會是平等的。 此外，還有一種情況。但是如果雙方均不愿意經(jīng)營該企業(yè)時，則在處理的時候會依照個人獨資企業(yè)法的相關(guān)規(guī)定解散企業(yè)，并進行清算。清算后的獨資企業(yè)財產(chǎn)由夫妻雙方對清算所得進行分割。但是，如果進行了清算解散之后，作為個人獨資企業(yè)的投資人仍然要對獨資企業(yè)在經(jīng)營的時候所產(chǎn)生的一切債務(wù)承擔(dān)連帶性的清償責(zé)任。而且在時間規(guī)定上面，自企業(yè)解散后五年內(nèi)，債權(quán)人仍然有權(quán)要求個人獨資企業(yè)的投資人就個人的全部財產(chǎn)對獨資企業(yè)的債務(wù)承擔(dān)責(zé)任。

夫妻以一方名義投資設(shè)立個人獨資企業(yè)的，人民法院分割夫妻在該個人獨資企業(yè)中的共同財產(chǎn)時，應(yīng)當(dāng)按照以下情形分別處理： （一）一方主張經(jīng)營該企業(yè)的，對企業(yè)資產(chǎn)進行評估后，由取得企業(yè)資產(chǎn)所有權(quán)一方給予另一方相應(yīng)的補償； （二）雙方均主張經(jīng)營該企業(yè)的，在雙方競價基礎(chǔ)上，由取得企業(yè)資產(chǎn)所有權(quán)的一方給予另一方相應(yīng)的補