區(qū)別是兩者的適用條件不一樣。在民事訴訟中，訴訟時(shí)效分為一般訴訟時(shí)效及最長訴訟時(shí)效。 一般訴訟時(shí)效3年，指的是自當(dāng)事人知道或應(yīng)該知道自己的權(quán)利被侵害時(shí)，當(dāng)事人應(yīng)當(dāng)在3年內(nèi)提起訴訟，若不斷發(fā)生新的侵權(quán)行為，則時(shí)效重新計(jì)算。而最長訴訟時(shí)效20年，自權(quán)利被侵害之日開始不中斷計(jì)算。即使當(dāng)事人不知情，自侵害發(fā)生之日的20年后，法院不予保護(hù)。

兩者的區(qū)別在于： 1、滯納金和違約金存在重大區(qū)別，分別屬于兩個(gè)不同的概念。 滯納金屬行政法律中的概念，是因行政管理相對(duì)人違反法律規(guī)定的繳費(fèi)義務(wù)例如稅費(fèi)等，由國家行政管理部門依法向行政管理相對(duì)人采取的一種懲罰性措施，具有國家強(qiáng)制性，發(fā)生在不平等的行政關(guān)系主體之間;違約金屬民事法律體系中的概念，是因違反合同約定、向?qū)Ψ街Ц兜木哂匈r償性的金錢給付義務(wù)，發(fā)生在平等民事關(guān)系主體之間。 2、違約金屬于對(duì)損失賠償。 我國《民法典》第一百一十二條規(guī)定：“當(dāng)事人一方違反合同的賠償責(zé)任，應(yīng)當(dāng)相當(dāng)于另一方因此所受到的損失。當(dāng)事人可以在合同中約定，一方違反合同時(shí)，向另一方支付一定數(shù)額的違約金;也可以在合同中約定對(duì)于違反合同而產(chǎn)生的損失賠償額的計(jì)算方法”，由此看出，違約金就是給對(duì)方所造成的損失賠償，違約金的數(shù)額相當(dāng)于另一方所受的損失，可以約定具體數(shù)額，也可以約定計(jì)算方法。