特殊工時制也是有加班費的。如果勞動者被安排在工作日加班，至少有百分之一百五十的加班費；如果在休息日加班且不能安排補休的，至少有百分之二百的加班費；如果在法定節(jié)假日加班的，則至少有百分之三百的加班費。

1、標準工時制下的加班費標準。實行標準工時制的員工加班的，用人單位應當按照下列標準支付加班費： (1)安排勞動者延長工作時間的，支付不低于工資的150%的工資報酬； (2)休息日安排勞動者工作又不能安排補休的，支付不低于工資的200%的工資報酬； (3)法定節(jié)假日安排勞動者工作的，支付不低于工資的300%的工資報酬。 根據(jù)上述規(guī)定，用人單位安排勞動者在休息日加班的，可以選擇安排補休或支付加班工資，決定權(quán)在用人單位。 但是，對于安排勞動者延時加班和在法定節(jié)假日加班的，則不能以安排補休形式代替支付加班費，用人單位必須按照法定標準支付加班費。 2、綜合計算工時制下的加班費標準。用人單位經(jīng)批準實行綜合計算工時工作制的，在綜合計算工時周期內(nèi)； 某一具體日(或周)的實際工作時間可以超過法定標準工作時間，即8小時(或40小時)，但如果計算周期內(nèi)勞動者的總實際工作時間超過總法定標準工作時間； 則超過的部分應視為延時加班，應當按照不低于員工工資150%的標準支付加班工資； 如果安排員工在法定節(jié)假日加班的，則應當按照不低于員工工資300%的標準支付加班工資。 在綜合計算工時制下，不存在休息日加班的情況，自然也不存在支付休息日加班費的問題。 3、不定時工作制下的加班費標準。用人單位經(jīng)批準實行不定時工作制的，由于工作性質(zhì)的特殊，勞動者每一工作日沒有固定上下班時間限制，不支付加班費。