有限責(zé)任公司的股東之間可以相互轉(zhuǎn)讓其全部或者部分股權(quán)，《股權(quán)轉(zhuǎn)讓協(xié)議書》系雙方當(dāng)事人的真實意思表示，符合自愿、公平的原則，且沒有違反法律和行政法規(guī)的強制性規(guī)定以及公司章程的規(guī)定，公司股東對此亦表示一致同意，該協(xié)議自簽訂之日起成立并生效。此外，雖然股東轉(zhuǎn)讓出資要進行股東變更登記，但對于股權(quán)轉(zhuǎn)讓協(xié)議，法律并無必須登記才生效的規(guī)定，且股東變更登記是對股東變更的公示方式，未辦理登記只是使得該股權(quán)轉(zhuǎn)讓行為原則上對公司以外不產(chǎn)生法律效力，而并不影響股權(quán)轉(zhuǎn)讓協(xié)議本身的效力，該協(xié)議對股權(quán)轉(zhuǎn)讓各方仍具有法律效力。所以股權(quán)轉(zhuǎn)讓協(xié)議和工商登記不符并不影響兩者的效力。若工商管理機關(guān)不予辦理變更登記手續(xù)可以有以下幾個處理辦法： (一)受讓股東可以向人民法院提起訴訟，要求確認(rèn)股權(quán)轉(zhuǎn)讓協(xié)議有效，并強制轉(zhuǎn)讓，由工商管理機關(guān)依據(jù)生效判決變更股權(quán)登記。 (二)受讓股東也可依據(jù)股權(quán)轉(zhuǎn)讓協(xié)議及其他變更文件，提起行政訴訟，起訴工商管理機關(guān)履行變更登記的職責(zé)。

這種情況，股權(quán)轉(zhuǎn)讓協(xié)議的效力應(yīng)具體分析： 第一，若是轉(zhuǎn)讓方不愿意為股權(quán)轉(zhuǎn)讓溢價繳納財產(chǎn)所得稅而簽訂的《股權(quán)轉(zhuǎn)讓協(xié)議》應(yīng)當(dāng)認(rèn)定無效。 第二，若工商局不接受復(fù)雜的《股權(quán)轉(zhuǎn)讓協(xié)議》或者是必須使用工商局提供的格式文本，應(yīng)當(dāng)以雙方實際履行的《股權(quán)轉(zhuǎn)讓協(xié)議》為真實意思表示。