具體看是什么糾紛，如果對使用權(quán)沒有異議的土地糾紛，對土地確權(quán)辦證并沒有影響，可以直接起訴至人民法院進(jìn)行判決；如果是土地使用權(quán)的爭議糾紛，則需由地方國土資源行政主管部門進(jìn)行調(diào)查處決后再進(jìn)行確權(quán)頒證。根據(jù)《土地權(quán)屬爭議調(diào)查處理辦法》第十四條的規(guī)定下列案件不作為爭議案件受理：（一）土地侵權(quán)案件；（二）行政區(qū)域邊界爭議案件；（三）土地違法案件；（四）農(nóng)村土地承包經(jīng)營權(quán)爭議案件；（五）其他不作為土地權(quán)屬爭議的案件。第二十條國土資源行政主管部門在調(diào)查處理爭議案件時(shí)，應(yīng)當(dāng)審查雙方當(dāng)事人提供的有關(guān)證據(jù)材料：（一）人民政府頒發(fā)的確定土地權(quán)屬的憑證；（二）人民政府或者主管部門批準(zhǔn)征收、劃撥、出讓或者以其他方式批準(zhǔn)使用土地的文件；（三）爭議雙方當(dāng)事人依法達(dá)成的書面協(xié)議；（四）人民政府或者司法機(jī)關(guān)處理爭議的文件或者附圖；（五）其他有關(guān)證明文件。第二十一條對當(dāng)事人提供的證據(jù)材料，國土資源行政主管部門應(yīng)當(dāng)查證屬實(shí)，方可作為認(rèn)定事實(shí)的依據(jù)。第二十二條在土地所有權(quán)和使用權(quán)爭議解決之前，任何一方不得改變土地利用的現(xiàn)狀。第三十一條當(dāng)事人對人民政府作出的處理決定不服的，可以依法行申請政復(fù)議或者提起行政訴訟。在規(guī)定的時(shí)間內(nèi)，當(dāng)事人既不申請政復(fù)議，也不提起行政訴訟，處理決定即發(fā)生法律效力。生效的處理決定是土地登記的依據(jù)。