醫(yī)學(xué)會鑒定多數(shù)時(shí)候受同行相護(hù)影響，參加鑒定醫(yī)生缺乏法律知識和證據(jù)認(rèn)知能力，鑒定人不署名、不出庭，使鑒定結(jié)論作為證據(jù)具有致命的程序缺陷。 醫(yī)療糾紛發(fā)生后，選擇醫(yī)療技術(shù)鑒定機(jī)構(gòu)需要高度重視，與案件的處理的最終結(jié)果息息相關(guān)。鑒定機(jī)構(gòu)的中立性與專業(yè)水平是最重要的考慮因素。

司法鑒定機(jī)構(gòu)主要是法院依法設(shè)立的專門從事司法鑒定的機(jī)構(gòu)。這種劃分是以目前從事何種鑒定為主業(yè)為標(biāo)準(zhǔn)，民間檢定機(jī)構(gòu)及行政鑒定機(jī)構(gòu)也可受法院委托從事司法鑒定。也有些司法鑒定機(jī)構(gòu)辦理非訴訟鑒定案件?！夺t(yī)療事故處理?xiàng)l例》第二十條，衛(wèi)生行政部門接到醫(yī)療機(jī)構(gòu)關(guān)于重大醫(yī)療過失行為的報(bào)告或者醫(yī)療事故爭議當(dāng)事人要求處理醫(yī)療事故爭議的申請后，對需要進(jìn)行醫(yī)療事故技術(shù)鑒定的，應(yīng)當(dāng)交由負(fù)責(zé)醫(yī)療事故技術(shù)鑒定工作的醫(yī)學(xué)會組織鑒定;醫(yī)患雙方協(xié)商解決醫(yī)療事故爭議，需要進(jìn)行醫(yī)療事故技術(shù)鑒定的，由雙方當(dāng)事人共同委托負(fù)責(zé)醫(yī)療事故技術(shù)鑒定工作的醫(yī)學(xué)會組織鑒定。第二十一條設(shè)區(qū)的市級地方醫(yī)學(xué)會和省、自治區(qū)、直轄市直接管轄的縣(市)地方醫(yī)學(xué)會負(fù)責(zé)組織首次醫(yī)療事故技術(shù)鑒定工作。省、自治區(qū)、直轄市地方醫(yī)學(xué)會負(fù)責(zé)組織再次鑒定工作。必要時(shí)，中華醫(yī)學(xué)會可以組織疑難、復(fù)雜并在全國有重大影響的醫(yī)療事故爭議的技術(shù)鑒定工作。