施工合同主體糾紛的原因主要有以下幾點(diǎn)：第一，由建設(shè)工程質(zhì)量引起的糾紛；第二，由承包商拖欠工程資金引起的糾紛；第三，附屬人和附屬人之間存在工程債務(wù)或管理費(fèi)用糾紛；第四，供應(yīng)商拖欠。雇員工資的糾紛。以下對(duì)各種類型的糾紛進(jìn)行分析：1、關(guān)于第一個(gè)糾紛，根據(jù)《說明》第25條的規(guī)定，如果建設(shè)工程質(zhì)量發(fā)生糾紛，承包人可以向雙重承包人、承包人和實(shí)際施工人提起訴訟，該規(guī)定與《意見》第43條的規(guī)定內(nèi)容一致。因此，因建設(shè)工程質(zhì)量問題產(chǎn)生的糾紛，應(yīng)以發(fā)包人為原告，總承包人．分包人和實(shí)際施工人為共同被告，在掛靠中就是掛靠人和被掛靠人都做為共同被告。2、關(guān)于第二次糾紛，發(fā)包人是債務(wù)人，受益人是名義債權(quán)人，受益人是實(shí)際債權(quán)人。根據(jù)合同相對(duì)性原理，掛靠人不能向發(fā)包人主張權(quán)利，只能由被掛靠人向發(fā)包人主張權(quán)利。但《解釋》第二十六條的規(guī)定，突破了合同相對(duì)性原理，賦予掛靠人為原告，可以以發(fā)包人為被告提起訴訟。3、關(guān)于第三種糾紛，在排除發(fā)包人欠付工程款以外，應(yīng)根據(jù)合同相對(duì)性來處理，即訴訟主體是掛靠雙方。如果發(fā)包人欠付工程款的，導(dǎo)致被掛靠人拖欠掛靠人工程款的，按《解釋》第二十六條規(guī)定，掛靠人為原告，發(fā)包人．被掛靠人為被告。但后兩者并不是共同被告，掛靠人可以選擇其中一個(gè)起訴，也可以選擇兩者都為被告。

《最高人民法院關(guān)于審理建設(shè)工程施工合同糾紛案件適用法律問題的解釋》第二十五條、第二十六條