甲類藥品100％按清算比例清算。例如，某統(tǒng)一地區(qū)員工住院醫(yī)療費(fèi)20000元，其中藥品費(fèi)7000元，甲類藥品5000元，乙類藥品1000元，非《藥品目錄》內(nèi)藥品費(fèi)1000元。該員工住院醫(yī)療費(fèi)用的支付方法如下：（1）非藥品目錄藥品費(fèi)用1000元，該員工全部自付（2）乙類藥品費(fèi)用1000元，該員工首先自付20％，即200元（3）甲類藥品費(fèi)用5000元和乙類藥品費(fèi)用80％（即800元），共計(jì)5800元與其他應(yīng)納入統(tǒng)一基金支付范圍的醫(yī)療費(fèi)用一起，按基本醫(yī)療保險(xiǎn)住院費(fèi)用的支付規(guī)定支付。

《社會(huì)保險(xiǎn)法》 第二十八條符合基本醫(yī)療保險(xiǎn)藥品目錄、診療項(xiàng)目、醫(yī)療服務(wù)設(shè)施標(biāo)準(zhǔn)以及急診、搶救的醫(yī)療費(fèi)用，按照國(guó)家規(guī)定從基本醫(yī)療保險(xiǎn)基金中支付。 第二十九條參保人員醫(yī)療費(fèi)用中應(yīng)當(dāng)由基本醫(yī)療保險(xiǎn)基金支付的部分，由社會(huì)保險(xiǎn)經(jīng)辦機(jī)構(gòu)與醫(yī)療機(jī)構(gòu)、藥品經(jīng)營(yíng)單位直接結(jié)算。社會(huì)保險(xiǎn)行政部門和衛(wèi)生行政部門應(yīng)當(dāng)建立異地就醫(yī)醫(yī)療費(fèi)用結(jié)算制度，方便參保人員享受基本醫(yī)療保險(xiǎn)待遇。