土地確權(quán)登記工作中不予發(fā)證的情況有下列情況之一的不予發(fā)證：1、承包戶的承包地被全部征收、征用、占用，導致農(nóng)村土地承包經(jīng)營權(quán)全部喪失的;2、承包戶的承包地被全部退耕還林并已經(jīng)發(fā)放林權(quán)證的;3、承包期內(nèi)承包方提出書面申請，自愿放棄全部或部分承包地的;4、承包期內(nèi)五保戶死亡的;5、土地權(quán)屬有爭議未解決的；6、土地違法行為尚未處理或正在處理的；7、申請的土地權(quán)利超過規(guī)定期限的；8、無合法用地等土地登記申請要件的；9、違反規(guī)劃改變土地用途的；六是查封登記解除前申請辦理登記的；10、未辦理土地使用權(quán)登記而設(shè)定抵押的；11、其他依法不予登記的和應(yīng)收回土地承包經(jīng)營權(quán)的。不予登記發(fā)證的，一般應(yīng)書面告知申請人不予登記發(fā)證的理由。土地確權(quán)存在問題及解決辦法1、妥善處理機動地、經(jīng)濟地、荒地等問題。凡是已納入承包地管理的，繼續(xù)作為承包地管理;未納入承包地管理的，不進行確權(quán)登記，但應(yīng)按實際面積登記在冊。2、在農(nóng)村土地承包期間，農(nóng)戶自行或者流轉(zhuǎn)給別人在承包地上建房、挖塘等改變農(nóng)業(yè)土地用途的，仍按原來承包地面積進行確權(quán)登記，在實測面積時減去占用面積，并進行備注。3、承包方土地承包經(jīng)營權(quán)共有人，應(yīng)以“二輪”土地延包時家庭實際承包人口為基礎(chǔ)，家庭個別成員已死亡或戶口遷出的(如出嫁女、遷入城鎮(zhèn)居住、在校大學生、現(xiàn)役軍人等)應(yīng)在備注欄標注清楚?！岸啞蓖恋匮影螅略黾彝コ蓡T應(yīng)依法享有土地承包經(jīng)營權(quán)的，一并作為共有人進行登記，并在備注欄標注?！芭c戶主關(guān)系”欄按照國家規(guī)范填寫，如本人、配偶、子女、父母、祖父母、孫子女、兄弟、姐妹、其他等。4、農(nóng)戶之間進行承包地互換的，互換后的土地沒有糾紛，按現(xiàn)在土地的承包人進行確權(quán)登記。對存在糾紛的，先解決糾紛再進行登記。對以轉(zhuǎn)包、出租、入股、抵押等方式流轉(zhuǎn)的土地，按原承包轉(zhuǎn)出農(nóng)戶登記，不給受轉(zhuǎn)者頒發(fā)土地承包經(jīng)營權(quán)證，其流轉(zhuǎn)關(guān)系繼續(xù)履行流轉(zhuǎn)合同約定。5、家庭承包人戶主死亡，在這次土地登記中，應(yīng)尊重承包農(nóng)戶意愿，作為原家庭共有人處理。6、承包農(nóng)戶家庭成員全部死亡的，其承包土地只登記不確權(quán)，暫由原負責贍養(yǎng)人繼續(xù)耕種、管理、收益。7、對第二輪土地延包后，個別村民小組進行了土地調(diào)整，應(yīng)按照“保持穩(wěn)定、尊重歷史、正視現(xiàn)實”的原則依法妥善解決。