1、建設(shè)目的不同經(jīng)濟適用房的建設(shè)具有保障性質(zhì)，建設(shè)目的是為了解決城市低收入住房困難家庭的住房問題，一般商品房建設(shè)不以保障為目的。2、土地性質(zhì)不同由于能夠享受政府優(yōu)惠政策，經(jīng)濟適用房所占用的建設(shè)用地是行政劃撥用地，而一般商品住房的建設(shè)用地是出讓土地，不但要通過公開招拍的程序，而且要按拍賣成交價向政府繳納土地出讓金。3、享受的優(yōu)惠政策不同的經(jīng)濟適用室除了享受土地計劃的優(yōu)惠外，還可以在很多方面享受政府的優(yōu)惠政策。一般商品住宅建設(shè)幾乎沒有優(yōu)惠政策。4、定價區(qū)別基于經(jīng)濟適用房的建設(shè)目的．土地性質(zhì)及所享有的優(yōu)惠政策，其價格是由政府限定的。而一般的商品住房價格受市場波動，由開發(fā)商自行決定，政府在通常情況下不干預(yù)。5、購房資質(zhì)區(qū)別一般商品房面向公眾銷售，購房者可根據(jù)自身能力主動購買。但申請購買經(jīng)濟適用房有嚴格的標準，也有嚴格的審批流程。申請人的住房面積．可支配收入．是否發(fā)生過住房交易等均會影響到購買人的申請資格。6、產(chǎn)權(quán)限制區(qū)別經(jīng)濟適用房的產(chǎn)權(quán)是受到一定限制的，比如其轉(zhuǎn)讓需要滿一定的年限。而一般的商品住房沒有上述限制。

《經(jīng)濟適用住房管理辦法》第三十條 經(jīng)濟適用住房購房人擁有有限產(chǎn)權(quán)。 購買經(jīng)濟適用住房不滿5年，不得直接上市交易，購房人因特殊原因確需轉(zhuǎn)讓經(jīng)濟適用住房的，由政府按照原價格并考慮折舊和物價水平等因素進行回購。 購買經(jīng)濟適用住房滿5年，購房人上市轉(zhuǎn)讓經(jīng)濟適用住房的，應(yīng)按照屆時同地段普通商品住房與經(jīng)濟適用住房差價的一定比例向政府交納土地收益等相關(guān)價款，具體交納比例由市、縣人民政府確定，政府可優(yōu)先回購；購房人也可以按照政府所定的標準向政府交納土地收益等相關(guān)價款后，取得完全產(chǎn)權(quán)。 上述規(guī)定應(yīng)在經(jīng)濟適用住房購買合同中予以載明，并明確相關(guān)違約責任。