1.參保對象不同： 職工醫(yī)療保險是為用人單位在職職工提供的醫(yī)療保障，而農村醫(yī)保參保對象主要是當地的村民。 2.繳費主體不同： 職工醫(yī)療保險是用人單位和社會成員個人共同繳納醫(yī)療保險費，農村醫(yī)保是由政府組織，農民自愿參加，個人、集體和政府多方籌資。 3.繳費方式不同： 醫(yī)療保險需要繳納時間達到一定的年限(一般需要連續(xù)繳納六個月)，用戶才可享受報銷待遇。新型農村合作醫(yī)療是農民自愿參加，需要每年辦理參保繳費手續(xù)。 4.報銷比例不同： 新農合在農村鄉(xiāng)鎮(zhèn)醫(yī)院的報銷比例最高，到市級以上醫(yī)院報銷比例相對社保較少。職工醫(yī)保一般在定點醫(yī)院看病報銷比例最高，其它醫(yī)院報銷比例會降低。

1、面對人群不同。城鎮(zhèn)職工醫(yī)保主要面向有工作單位或從事個體經濟的在職職工和退休人員。城鎮(zhèn)居民醫(yī)保主要面對具有城鎮(zhèn)戶籍的沒有工作的老年居民、低保對象、重度殘疾人、學生兒童及其他城鎮(zhèn)非從業(yè)人員、繳費標準及來源不同。城鎮(zhèn)職工醫(yī)保由用人單位和職工個人共同繳納，不享受政府補貼。城鎮(zhèn)居民醫(yī)保繳費標準總體上低于職工醫(yī)保，在個人繳費基礎上政府給予適當補貼、待遇標準不同。城鎮(zhèn)居民醫(yī)保由于籌資水平較低，醫(yī)療待遇標準總體上略低于職工醫(yī)保。 4、繳費要求不同。城鎮(zhèn)職工醫(yī)療保險設立最低繳費年限，達到繳費年限(男25年、女20年)的，退休后不再繳費即可享受基本醫(yī)療保險待遇鎮(zhèn)居民醫(yī)療保險不設立最低繳費年限，必須每年繳費，不繳費不享受待遇。