國有企業(yè)改制遺留的矛盾糾紛： 1、出讓、兼并、分立的合同當(dāng)事人不履行合同，或不全面履行合同，形成糾紛后，企業(yè)停頓。 2、出讓方或者某一當(dāng)事方，不履行對相關(guān)債務(wù)和隱蔽債務(wù)、或有債務(wù)的告知義務(wù)，形成糾紛給收購方造成損失。 3、國企的公司制改建中，采取多種規(guī)避法律的行為，架空債務(wù)，逃避債務(wù)，不事先征求債權(quán)人的意見等等。 4、企業(yè)國有產(chǎn)權(quán)轉(zhuǎn)讓，違法暗箱操作。 解決： 1、嚴格執(zhí)行政府和最高法院的有關(guān)規(guī)范性文件的規(guī)定，妥善處理好國企改制遺留的問題。 2、應(yīng)當(dāng)按照民事訴訟法、仲裁法和最高法院的有關(guān)司法解釋，依法以訴訟或仲裁等方式解決。 3、維護職工群眾合法權(quán)益，破解改革成本難題。 4、解決國有企業(yè)的歷史遺留問題。 5、政府各級主管機構(gòu)，應(yīng)當(dāng)強化工作責(zé)任，健全相互之間的協(xié)調(diào)機制，禁止相互推諉和不負責(zé)任。

國有企業(yè)改制股權(quán)的退股方式如下：先要對企業(yè)進行資產(chǎn)評估，然后以此為底價對企業(yè)進行整體拍賣，以實際拍賣價格減去債務(wù)包括應(yīng)支付沒有支付的潛在債務(wù)如職工工資保險、應(yīng)繳稅金等，就是所有者權(quán)益，用所者權(quán)益除以股份數(shù)就是每股凈值；制定企業(yè)改制方案并形成有效的股東會決議，清產(chǎn)核資，界定企業(yè)產(chǎn)權(quán)，資產(chǎn)評估，財務(wù)審計，認繳出資，申請登記。